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尊龙凯时代谢组学常见问答(五)

发布时间:2025-02-13   信息来源:尊龙凯时官方编辑

尊龙凯时生物科技领域中的数据分析方法有助于推动研究和应用的发展。今天,我们将探讨Q1PLS-DA和OPLS-DA二维图的分析,以及多糖提取后的结构分析技术。

尊龙凯时代谢组学常见问答(五)

Q1PLS-DA与OPLS-DA二维图的R²值解析

关于大样本中R²值大于0.2的可接受性,主要依赖于实际应用和领域需求。在生物学和化学计量学领域,由于数据的复杂性和噪声的影响,R²值大于0.2可能被视为足够。然而,通常来说,较高的R²值意味着更好的模型拟合与预测能力。尽管对于R²值的可接受范围没有统一的标准,实际应用中应结合其他评估指标,如预测性残差平方和(PRESS)、Q²值(交叉验证决定系数)等,综合评估模型的性能及稳定性。

在解读OPLS-DA或PLS-DA二维图时,还应考虑主成分的贡献、变量的负荷图以及样本分布等信息,这对全面评估模型的可靠性至关重要。因此,针对大样本的R²大于0.2的接受程度,具体分析应依据研究背景与实际需求。

载荷图的分析方法

PLS(偏最小二乘法)分析中,载荷图用于揭示潜变量与观测变量之间的关系。以下为载荷图分析的基本步骤:

  1. 观察坐标系:载荷图在二维坐标系中显示,X轴代表第一个主成分,Y轴则表示第二个主成分。
  2. 识别观测变量:在坐标系中,观测变量通过点或标签呈现,它与潜变量息息相关。
  3. 确定潜变量:潜变量以向量形式表示,起点为坐标原点,终点指向相应的观测变量。角度越小,表明相关性越高。
  4. 分析观测变量的关系:观测变量在载荷图上的位置反映它们之间的相关性,接近位置表示高相关性,远离则表示低相关性。
  5. 计算载荷值:该值表征观测变量与潜变量间的关系,范围从-1到1,数值越接近1为正相关,越接近0则代表弱相关。
  6. 评估模型解释能力:观察载荷图的聚集程度,聚集良好则说明模型的解释能力优秀,反之则表明较差。

多糖的结构分析技术

在多糖提取后的结构分析中,除了红外光谱(FT-IR),还有多种技术可选用,以确认单糖组成和连接方式等信息:

  1. 核磁共振(NMR)光谱分析:提供有关多糖的详细结构信息,包括糖残基类型及连接方式。
  2. 质谱分析(MS):此技术分析多糖的分子质量与组成,为解读其部分结构提供支持。
  3. 圆二色光谱(CD):对具有光学活性的多糖,CD可探测其三维结构的光学性质。
  4. 光谱分析:包括拉曼光谱和紫外-可见光谱等,提供多糖基团的振动信息。
  5. X射线晶体学分析:当多糖晶体合适时,此技术可揭示其三维原子级结构。

在选择分析方法时,应依据研究目标与样品特性来决定,综合多种分析结果将更有助于了解多糖的结构特征。

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